En 1988, la Fédération CJA commence à nouer des liens étroits avec Beer Sheva, capitale du Néguev, et avec la région environnante de B’nai Shimon. Au fil des ans, les Montréalais ont grandement contribué à l’amélioration de la qualité des services sociaux et de l’éducation dans cette partie d’Israël. En 1991, la chute de l’Union soviétique permet aux Juifs de quitter le pays. Alors que la majorité d’entre eux choisissent de s’établir en Israël, plus de 3 400 s’installent à Montréal. Au même moment, Israël commence à secourir les Juifs éthiopiens qui sont aux prises avec des conditions de vie désastreuses dans leur pays fragilisé. Une grande partie de ces réfugiés s’installent dans la région de Beer Sheva, et les Montréalais épousent tout naturellement leur cause. De nombreux projets sont mis sur pied pour intégrer ces nouveaux olim avec succès. Le second référendum sur la souveraineté du Québec se tient en octobre 1995. 93 % des électeurs se prévalent alors de leur droit de vote, une première au Québec. Cette fois, le résultat du vote s’avère des plus serrés : 50,1 % des Québécois se prononcent contre la souveraineté du Québec. Peu de temps après, tandis qu’une lutte entre souverainistes et fédéralistes mine les relations entre le Québec et le gouvernement fédéral, ce dernier adopte une motion conférant au Québec le statut de société distincte.